• شماره ركورد
    25605
  • شماره راهنما
    BIOTECH2 392
  • عنوان

    تشخيص سريع ملكولي باكتري استرپتوكوكوس پايوژنز با استفاده از روش تكثير هم¬دما

  • مقطع تحصيلي
    كارشناسي ارشد
  • رشته تحصيلي
    زيست فناوري ميكروبي
  • دانشكده
    علوم و فناوري‌‌‌هاي زيستي
  • تاريخ دفاع
    1404/07/26
  • صفحه شمار
    63 ص .
  • استاد راهنما
    محسن گلابي
  • استاد مشاور
    سهيلا عباسي
  • كليدواژه فارسي
    آغازگر عمومي‌ , تكثير هم¬دما بواسطه حلقه , ژل الكتروفورز , استرپتوكوكوس پايوژنز , تشخيص ملكولي , تشخيص سريع
  • چكيده فارسي
    بر اساس پيشينه¬ي تاريخي بيماري‌‌هاي ناشي از ‌استرپتوكوك‌ها بيشتر از دو هزار سال است كه شناخته ‌شده‌اند و در دنياي امروز يكي از اصلي¬ترين علل مشكلات بهداشتي در جهان باقي است. طبق تحقيقات استرپتوكوك‌ها جزو اولين موجوداتي بودند كه بعنوان عامل بيماري‌‌هاي مسري شناخته شدند و وجودشان موجب توسعه روش‌هاي استريل در بيمارست‌آن‌هاشد. ‌استرپتوكوك¬ها از راسته لاكتوباسيل¬ها مي‌¬باشند و به طور معمول باكتري‌هايي گرم مثبت، غيرمتحرك، بي¬هوازي اختياري و فاقد توانايي اسپورسازي و اكسيداز منفي اند. يكي¬از مهم¬ترين ‌گونه‌هاي اين خانواده، ‌استرپتوكوكوس پايوژنز است كه بيماري¬زا مي‌ باشد. نكته¬ي مهم در رابطه با بيماري¬‌هاي حاصل از ‌استرپتوكوكوس پايوژنز تشخيص سريع عامل بيماري¬زا و به دنبال آن شروع درمان براي حفظ جان بيمار است و اكثر بيماري¬‌هاي حاصل اين باكتري توسط آنتي¬بيوتيك، بهبود مي‌يابد. اين باكتري، سم¬هايي توليد مي‌‌كند از جمله مي‌توانبه هموليزين‌ها، پروتئازها، سوپرآنتي‌ژن‌ها اشاره كرد. اين سموم موجب تخريب كليه‌ها (گلومرولونفريت)، دريچه‌‌هاي قلبي (تب روماتيسمي‌)، پوست (مخملك) و از بين رفتن بافت مي‌‌شود. يكي از متداول¬ترين روش تشخيص، كشت بزاق و مخاط بيمار با سواپ بر روي محيط كشت آگار داراي خون و ديسك باسيتراسين است كه در صورت مثبت شدن كشت، نوع آنتي¬بيوتيك مناسب براي درمان مشخص مي‌¬شود. با در نظر گرفتن اين نكته كه انجام مراحل كشت و تشخيس جنس و گونه زمان‌بر است، پزشك معالج، درمان را در ساعت¬‌هاي اوليه¬ي بروز علائم باليني و ظاهري در بيماران مشكوك و داراي علائم، از آنتي‌بيوتيك¬‌هاي وسيع¬الطيف آغاز مي‌¬كند. اين آنتي¬بيوتيك¬ها داراي اثرات و عوارض سوء هستند. پس اگر عامل بيماري‌زا سريعا تشخيص داده شود، آنتي¬بيوتيك درماني به صورت هدفمند و جهت¬دار هدايت مي‌-شود. هدف اين پژوهش تشخيص سويه¬‌هاي ‌استرپتوكوكوس پايوژنز با روش تكثير هم¬دما بواسطه¬ي حلقه است.آزمون LAMP يك روش سريع، ارزان و در دسترس جهت تشخيص و تكثير زنجيره¬‌هاي اسيد نوكلئيك است. آغازگر¬‌هاي اين واكنش از ژن اختصاصي scpC طراحي شد. در شناسايي اختصاصي خانواده ‌استرپتوكوكاسه از ژن pflB براي طراحي آغازگر تكنيك تكثير هم‌دما به واسطه حلقه استفاده شد. شناسايي خانواده يكي از جديدترين كارهايي است كه در اين پژوهش انجام شده و تا به الان تحقيقي در رابطه با شناسايي اختصاصي يك خانواده موجود نيست. اين پژوهش بخش كوچكي از يك پروژه بزرگ مي‌ باشد كه در آن هدف، شناسايي يك باكتري ناشناس در سريع‌ترين زمان ممكن است. حال در اين پژوهش به شناسايي بخشي از خانواده استرپتوكوكاسه به صورت اختصاصي و شناسايي باكتري استرپتوكوكوس پايوژنز پرداخته شده‌است.
  • كليدواژه لاتين
    General primer , Loop-mediated isothermal amplification , Gel electrophoresis , Streptococcus pyogenes , Molecular diagnosis , Rapid diagnosiS
  • عنوان لاتين
    Rapid molecular detection of Streptococcus pyogenes bacteria using isothermal amplification method
  • گروه آموزشي
    زيست فناوري
  • چكيده لاتين
    Historically, diseases caused by streptococci have been known for more than two thousan‎d years an‎d remain one of the main causes of health problems in the world today. According to research, streptococci were among the first organisms to be identified as the cause of infectious diseases, an‎d their existence led to the development of sterile methods in their treatment. Streptococci are from the order of lactobacilli an‎d are usually gram-positive, non-motile, facultative anaerobes, an‎d lack the ability to form spores an‎d are oxidase negative. One of the most important species of this family is Streptococcus pyogenes, which is pathogenic. The important point regarding diseases caused by Streptococcus pyogenes is the rapid diagnosis of the pathogen an‎d the initiation of treatment to save the patientʹs life, an‎d most diseases caused by this bacterium are cured by antibiotics. This bacterium produces toxins, including hemolysins, proteases, an‎d superantigens. These toxins cause damage to the kidneys (glomerulonephritis), heart valves (rheumatic fever), skin (scarlet fever), an‎d tissue loss. One of the most common diagnostic methods is to culture the patientʹs saliva an‎d mucus with a swab on agar medium containing blood an‎d a bacitracin disk. If the culture is positive, the appropriate antibiotic for treatment is determined. Considering that the stages of culture an‎d identification of genus an‎d species are time-consuming, the treating physician begins treatment with broad-spectrum antibiotics in the early hours of the onset of clinical an‎d apparent symptoms in suspected an‎d symptomatic patients. These antibiotics have adverse effects an‎d complications. So if the pathogen is identified quickly, antibiotic therapy is directed in a targeted an‎d directed manner. The aim of this study is to identify Streptococcus pyogenes strains by the isothermal loop amplification method. The LAMP test is a fast, cheap an‎d accessible method for detecting an‎d amplifying nucleic acid chains. The primers for this reaction were designed from the specific scpC gene. In the specific identification of the Streptococcus family, the pflB gene was used to design the primer for the isothermal loop amplification technique. Family identification is one of the most recent works carried out in this study an‎d so far there is no research on the specific identification of a family. This study is a small part of a large project in which the aim is to identify an unknown bacterium as quickly as possible. Now, in this study, the specific identification of a part of the Streptococcus family an‎d the identification of the Streptococcus pyogenes bacterium have been addressed.
  • تعداد فصل ها
    4
  • فهرست مطالب pdf
    154530
  • نويسنده

    شاه بختي، نگين