• شماره ركورد
    25598
  • شماره راهنما
    BIO3 213
  • عنوان

    مطالعه روابط فيلوژنتيكي مولكولي و تخمين اندازه ژنوم در گونه‌هاي جنس Tilia L. (Malvaceae) در ايران

  • مقطع تحصيلي
    دكتري
  • رشته تحصيلي
    زيست شناسي گياهي- سيستماتيك
  • دانشكده
    علوم و فناوري‌‌‌هاي زيستي
  • تاريخ دفاع
    1404/10/03
  • صفحه شمار
    80 ص .
  • استاد راهنما
    علي باقري , پروفسور فرانك بلاتنر
  • استاد مشاور
    دكتر حبيب زارع , دكتر دورته هارپك
  • كليدواژه فارسي
    نمدار , جنگل‌هاي هيركاني , فيلوژنتيك , ساختار جمعيتي , GBS , اندازه ژنوم , پلي‌پلوئيدي , Caucasica , Tilia dasystyla subsp
  • چكيده فارسي
    جنس Tilia از عناصر شاخص پوشش جنگلي هيركاني در شمال ايران است و تاكنون گزارش‌هاي متفاوتي درباره وضعيت گونه‌اي آن ارائه شده است. در اين پژوهش، به‌منظور بررسي روابط فيلوژنتيكي، ساختار جمعيتي و سطح پلوئيدي نمدارهاي ايران، مجموعه‌اي از نمونه‌ها از جنگل‌هاي هيركاني و همچنين تعدادي نمونه اروپايي مطالعه شد. براي اين منظور، دو رويكرد مكمل شامل Genotyping-by-Sequencing (GBS) جهت توليد هزاران نشانگر ژنتيكي و تحليل روابط فيلوژنتيكي، و نيز تخمين اندازه ژنوم براي استنباط سطح پلوئيدي به كار گرفته شد. داده‌هاي GBS امكان بازسازي درخت‌هاي فيلوژنتيكي با روش‌هاي ML و MP، تحليل شبكه‌اي و ارزيابي ساختار جمعيتي با استفاده از PCA و مدل‌هاي اختصاص جمعيتي را فراهم كرد. نتايج نشان داد كه نمونه‌هاي ايرانيِ جمع‌آوري‌شده در اين پژوهش يك گروه ژنتيكي نسبتاً منسجم را تشكيل مي‌دهند و بيشترين شباهت آن‌ها با Tilia dasystyla subsp. caucasica مشاهده مي‌شود. ارزيابي اندازه ژنوم نيز الگوي سازگار با سطح پلوئيدي تتراپلوئيد را در تمامي نمونه‌هاي ايراني تأييد كرد، در حالي كه نمونه‌هاي اروپايي عمدتاً ديپلوئيد بودند. در ميان نمونه‌هاي هيركاني، گروهي از درختان با براكته‌هاي قاشقي‌شكل، مشابه آنچه براي T. sabetii توصيف شده است، شناسايي شدند كه از نظر ريخت‌شناسي قابل تشخيص بودند. تركيب داده‌هاي GBS و اندازه ژنوم تصويري يكپارچه از روابط فيلوژنتيكي و سطح تنوع موجود در نمدارهاي هيركاني ارائه كرد و نشان داد كه بخش عمده تفاوت‌هاي مشاهده‌شده در سطح جمعيتي است. اين يافته‌ها مي‌تواند مبنايي براي بازنگري دقيق‌تر در طبقه‌بندي تاكسون‌هاي Tilia در ايران و برنامه‌ريزي حفاظتي مبتني بر شواهد ژنتيكي در جنگل‌هاي هيركاني باشد.
  • كليدواژه لاتين
    Tilia , Hyrcanian forests , phylogenetics , population structure , Genotyping-by-Sequencing (GBS) , genome size , polyploidy , Tilia dasystyla subsp
  • عنوان لاتين
    Study of Molecular Phylogenetic relationships an‎d estimation of Genome Size in species of the genus Tilia L. (Malvaceae) in Iran.
  • گروه آموزشي
    زيست شناسي گياهي و جانوري
  • چكيده لاتين
    The genus Tilia is one of the characteristic elements of the Hyrcanian forest vegetation in northern Iran, yet previous reports have offered differing accounts of its species composition. In this study, to investigate the phylogenetic relationships, population structure, an‎d ploidy level of Iranian limes, a set of samples from the Hyrcanian forests, together with several European accessions, was examined. Two complementary approaches were employed: Genotyping-by-Sequencing (GBS) to generate thousan‎ds of SNP markers an‎d infer phylogenetic relationships, an‎d genome size estimation to determine ploidy levels. The GBS dataset enabled the reconstruction of phylogenetic trees using ML an‎d MP methods, network analyses, an‎d assessments of population structure via PCA an‎d ancestry models. The results showed that the Iranian samples collected in this study form a relatively cohesive genetic group, most closely aligned with Tilia dasystyla subsp. caucasica. Genome size analyses further indicated a consistent tetraploid pattern across all Iranian samples, whereas the European specimens were predominantly diploid. Within the Hyrcanian material, a subset of trees with spoon-shaped bracts, morphologically similar to T. sabetii, was identified an‎d could be distinguished based on morphology. Integrating GBS data with genome size information provided a unified perspective on the phylogenetic relationships an‎d diversity patterns in the Hyrcanian limes, revealing that most observed differences occur at the population level rather than at the species level. These findings provide a basis for a more refined taxonomic reassessment of Tilia in Iran an‎d for conservation planning informed by genetic evidence in the Hyrcanian forests.
  • تعداد فصل ها
    4
  • فهرست مطالب pdf
    154425
  • نويسنده

    اعلا، نسترن