• شماره ركورد
    24401
  • شماره راهنما
    BIO2 1055
  • عنوان

    مقايسه بيان ژن‌هاي ARHGAP36 و IGSF1در بافت‌هاي سرطاني تيروئيد پاپيلاري و بافت‌هاي سالم مجاور آن در استان اصفهان، ايران

  • مقطع تحصيلي
    كارشناسي ارشد
  • رشته تحصيلي
    زيست شناسي سلولي مولكولي - ژنتيك
  • دانشكده
    علوم و فناوري‌‌‌هاي زيستي
  • تاريخ دفاع
    1403/11/03
  • صفحه شمار
    128 ص.
  • استاد راهنما
    دكتر سيد مرتضي جوادي راد
  • استاد مشاور
    دكتر محسن كلاهدوزان
  • كليدواژه فارسي
    سرطان پاپيلاري تيروئيد (PTC) , ARHGAP36 , IGSF1 , RT-qPCR
  • چكيده فارسي
    سرطان پاپيلاري تيروئيد (PTC)، فراوان‌ترين بدخيمي غدد درون ريز است كه علت بروز آن همچنان ناشناخته است. بنابراين، شناسايي ژن‌هاي دخيل در توسعه اين بيماري از اهميت ويژه‌اي برخوردار است. دو ژن ARHGAP36 و IGSF1 كه به ترتيب در انتقال پيام سلولي و تعاملات بين سلولي نقش دارند، ممكن است در بروز PTC نيز نقش داشته باشند. اين مطالعه با هدف مقايسه ميزان بيان mRNAي دو ژن‌ ARHGAP36 و IGSF1 در تومورهايPTC و بافت سالم مجاور تومور PTC، انجام شد. داده‌هاي ريزآرايه و RNA-seq از پايگاه‌هاي داده، استخراج و تحليل شدند. نمونه‌هاي باليني نيز از بيمارستان سينا (اصفهان) تهيه و با استفاده از روش RT-qPCR بررسي شدند. تجزيه‌وتحليل‌هاي آماري با استفاده از نرم‌افزارهاي REST2009، GraphPad Prism 10 و IBM SPSS Statistics 27 انجام شد. بررسي داده‌هاي ريزآرايه و RNA-Seq نشان داد كه هر دو ژن ARHGAP36 و IGSF1 بيان متفاوتي در تومورهاي PTC نسبت به بافت‌هاي طبيعي مجاور دارند. نتايج RT-qPCR نيز نشان داد كه بيان هر دو ژن در بيشتر تومورهاي PTC افزايش يافته است. با اين حال، بيان نشدن ARHGAP36 همراه با كاهش بيان IGSF1 در برخي تومورها، ديده شد. افزايش بيان اين دو ژن در اكثر بافت‌هاي مورد بررسي و عدم بيان ARHGAP36 همراه با كاهش بيان IGSF1 در برخي تومورها، با مشاهده الگوي مشابهي در تغييرات بيان ژن CDH1 تأييد شد. افزايش بيان اين ژن‌ها در PTCهاي متاستاز يافته به غدد لنفاوي نيز ديده شد. اگرچه تفاوت معني‌داري در بيان ژن ARHGAP36 بين تومورهاي متاستاتيك و غيرمتاستاتيك ديده نشد، اما كاهش قابل توجهي در بيان ژن IGSF1 در اين مقايسه شناسايي شد. افزون بر اين، بيان ژن IGSF1 در بافت‌هاي گواتر در مقايسه با بافت‌هاي طبيعي مجاور تومور PTC افزايش يافت. نتايج اين پژوهش، نقش‌هاي بالقوه دوگانه ژن‌هاي ARHGAP36 و IGSF1 در بروز و پيشرفت PTC را نشان داد كه نيازمند مطالعات بيشتر براي درك ساز و كارهاي مولكولي مرتبط است.
  • كليدواژه لاتين
    Papillary thyroid carcinoma(PTC) , ARHGAP36 , RT-qPCRIGSF1
  • عنوان لاتين
    Comparison of ARHGAP36 and IGSF1 genes expression in papillary thyroid cancer tissue and adjacent healthy tissues in the patients of Isfahan Province, Iran
  • گروه آموزشي
    زيست شناسي سلولي مولكولي و ميكروبيولوژي
  • چكيده لاتين
    Papillary thyroid carcinoma (PTC) is the most preva‎lent endocrine malignancy yet its etiology remainsunclear., identifiying the genes involved in its development is therefore of significant importance. ARHGAP36 and IGSF1, two genes involved in the cellular signaling and intercellular interactions, respectively, may play crucial roles in PTC pathogenesis. This study aimed to compare the mRNA expression levels of ARHGAP36 and IGSF1 between PTC tumors and adjacent normal tissues. Microarray and RNA-seq data were collected from public databases for analysis. Additionally, clinical samples were collected from Sina Hospital (Isfahan) and analyzed using RT-qPCR. Statistical analyses were performed using REST2009, GraphPad Prism 10, and IBM SPSS Statistics 27 software. Both ARHGAP36 and IGSF1 were identified as differentially expressed genes between PTC tumors and adjacent normal tissues, based on microarray and RNA-seq data. The RT-qPCR results revealed that both genes were upregulated in the majority of PTC tumors; however, some tumors exhibited a lack of ARHGAP36 expression accompanied by decreased IGSF1 expression. The observed upregulation of these two genes and the lack of ARHGAP36 expression coupled with decreased IGSF1 expression in some tumors were further validated by a similar pattern of CDH1 expression changes. Increased expression of ARHGAP36 and IGSF1 was also observed in lymph node metastases. While no significant variation in ARHGAP36 expression was observed between metastatic and non-metastatic tumors, a considerable decrease in IGSF1 expression was identified in the metastatic tumors in comparison with the non-metastatic tumors. Furthermore, IGSF1 expression was higher in goiter tissues compared to adjacent normal tissues.These findings suggest that ARHGAP36 and IGSF1 may have dual roles in the initiation and progression of PTC, warranting further investigation to elucidate their molecular mechanisms.
  • تعداد فصل ها
    4
  • فهرست مطالب pdf
    120566
  • نويسنده

    ثامري، الهام