-
شماره ركورد
24039
-
شماره راهنما
BIOTECH2 363
-
نويسنده
شمس، ريحانه
-
عنوان
بررسي اثر سفيده ي تخم هشت گونه پرنده بر روي باكتري هاي بيماري زا و لنفوسيت هاي انسان و مطالعه ي ژن هاي پروتئين اووالبومين موجود در سفيده با استفاده از روش¬هاي بيوانفورماتيكي
-
مقطع تحصيلي
كارشناسي ارشد
-
رشته تحصيلي
زيست فناوري ميكروبي
-
دانشكده
علوم و فناوريهاي زيستي
-
تاريخ دفاع
1395/5/29
-
صفحه شمار
69 ص.
-
استاد راهنما
دكتر ماندا بهبهاني , دكتر حسن محبت كار
-
كليدواژه فارسي
محتوي نوكلئوتيدي كاذب , اثر ضد باكتريايي , سفيده تخم , الگوريتم¬هاي يادگيري ماشين , تكثير لنفوسيت
-
چكيده فارسي
سفيده¬ي تخم پرندگان يك محيط رشد پيچيده¬ي چندمنظوره¬اي جهت رشد جنين بوده و از انواع مواد مهم مغذي از قبيل پروتئين¬ها، آنزيم¬ها، ليپيدها و انواع مواد فعال زيستي از جمله فاكتورهاي رشد تشكيل شده است. سفيده¬¬ي تخم پرندگان داراي پروتئين¬هاي بسياري بوده كه داراي ويژگي¬هاي خاص بوده كه از جمله¬ي آن¬ها اووترانسفرين (كونالبومين)، اووآلبومين، ليزوزيم، اووموسين، اووموكوئيد، اووگلوبولين، آويدين، سيستاتين، اووفلاووپروتئين و اوواينهيبيتور مي¬باشند. در سال¬هاي اخير چندين مطالعه روي اثرات ضدباكتريايي، ضد ويروسي، ضد سرطاني و ضد التهابي سفيده¬ي تخم پرندگان انجام گرفته است. هدف از اين پژوهش بررسي آزمايشگاهي پتانسيل ضد باكتريايي و القاكنندگي بر رشد و تكثير لنفوسيت¬هاي انساني توسط سفيده¬ي تخم هشت گونه پرنده شامل بوقلمون با نام علمي gallopavo Meleagris، كبك با نام علمي Bambusicola thoracicus، كبوتر با نام علمي Columba livia، مرغ با نام علمي Gallus gallus، مرغ محلي با نام علمي domestic Gallus gallus، بلدرچين با نام علمي Coturnix coturnix، اردك با نام علمي Anas platyrhynchos و مرغ عشق با نام علمي Melopsittacus undulatus است. به اين منظور قابليت ضد باكتريايي و تحريك كنندگي رشد غلظت¬هاي مختلف سفيده¬ي تخم¬ها به ترتيب با استفاده از روش¬هاي انتشار ديسك و آزمون MTT مورد بررسي قرار گرفت. هم¬چنين در تحقيق حاضر به ارائه¬ي روشي رايانه¬اي براي طبقه¬بندي و پيش¬بيني ژن¬هاي اووالبومين موجود در سفيده بر پايه¬ي مفهوم محتوي نوكلئوتيدي كاذب (PseKNC) پرداخته شده است. به اين منظور الگوريتم¬هاي مختلف بر اساس عملكرد خود در طبقه¬بندي و شناسايي ژن¬هاي اووالبومين مقايسه شدند. الگوريتم شبكه¬ي عصبي داراي بهترين عملكرد با دقت 8/98 درصد در پيش¬بيني ژن¬هاي اووالبومين بود. نتايج حاصل از MTT نشان داد سفيده¬ي تخم تمامي پرندگان موجب افزايش تكثير لنفوسيت¬ها مي¬شود. بيشترين و كمترين تأثير روي تكثير لنفوسيت¬ها به ترتيب مربوط به سفيده¬ي تخم اردك و مرغ عشق بوده است. هم¬چنين نتايج آزمون ضد باكتريايي نشان داد كه سفيده¬ي تمامي پرنده¬ها به جز سفيده¬ي تخم مرغ عشق در غلظت¬هاي مشخص داراي خاصيت ضد باكتريايي عليه باكتري¬ها مي¬باشند. بيشترين و كمترين اثر به ترتيب مربوط به سفيده¬ي تخم مرغ بومي و كبوتر بود.
-
كليدواژه لاتين
Pseudo nucleotide composition , Antibacterial , Egg white , Machine learning , Lymphocyte proliferation
-
عنوان لاتين
Effect of egg white of brids on pathogenic bacteria and human lymphocyte and bioanformatic studeing of ovalbumin gens
-
گروه آموزشي
زيست فناوري
-
چكيده لاتين
Avian albumen is a complex multifunctional medium promoting the growth of the embryo.It is composed of various important nutrients such as proteins, lipids, enzymes and various biologically active substances including growth promoting factors. Avian egg whites contain many proteins that have specific properties such as Ovotransferrin (Conalbumin), Ovalbumin, Lysozyme, Ovomucin, Ovomucoid, Ovoglobulin, Avidin, Cystatin, Ovoflavoprotein and Ovoinhibitor. In recent decades, several studies have been carried out about anti-bacterial, anti-viral, anti-cancer and anti-inflammatory activities of egg whites. The aims of this study were to evaluate antibacterial and cytotoxicity effects of eight bird egg whites against 10 pathogenic bacteria and human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs). The studied species were Meleagris gallopavo, Bambusicola
thoracicus, Columba livia , Gallus gallus, domestic Gallus gallus, Coturnix coturnix, Anas platyrhynchos and Melopsittacus undulatus.
The antibacterial and cytotoxic activities of different concentration of egg whites were performed by disk diffusion and MTT assays respectively. Also, in the present study, we have developed a computer based method for the classification and screening of ovalbumin genes based on the pseudo nucleotide composition (PseKNC) concept and machine learning algorithms. For this propose, different algorithms were compared based on their performance in classifying and predicting ovalbumin genes. The results showed that the Neural net algorithm had the best performance with accuracy of 98.8 percent in predicting ovalbumin genes. The results of MTT assay showed that All these eggs white increased lymphocyte cell proliferation. The most and the least active eggs white on PBMC proliferation were related to Anas platyrhynchos and Melopsittacus
undulates respectively. The result of antibacterial assay demonstrated that all egg whites have an antibacterial effect against bacteria except Melopsittacus undulates. The highest and lowest anti-bacterial effects were obtained in the presence of domestic Gallus gallus and Columba livia
eggs white respectively.
-
تعداد فصل ها
4
-
لينک به اين مدرک :